Méthode Sakiti

Open Source Healthcare & BioTech Academy

Former aux systèmesde santé numériques ouverts

De la donnée au patient, du laboratoire à l’innovation : concevoir, intégrer, exploiter et gouverner des systèmes de santé numériques, avec les standards ouverts et la protection des données comme exigences de conception.

Les garde-fous, avant le programme

Dans ce domaine, ce qu’un dispositif de formation s’interdit compte autant que ce qu’il enseigne.

Aucune donnée patient réelle dans les exercices ordinaires. Le laboratoire est isolé et alimenté exclusivement en données synthétiques ou dûment autorisées.

Un prototype n’est jamais présenté comme un dispositif médical validé. Ni un modèle d’intelligence artificielle, ni un capteur, ni une bibliothèque de recherche ne relèvent d’un usage clinique du seul fait qu’ils fonctionnent.

La validation clinique et scientifique appartient à des professionnels qualifiés. Les expériences biologiques relèvent des règles de biosécurité applicables. Les obligations juridiques locales doivent être vérifiées avant tout traitement de données de santé ou déploiement en établissement. Et aucun diplôme reconnu, homologation ou certification n’est promis sans preuve officielle.

L’académie santé et biotechnologies : six filières complémentaires et progression
              pédagogique en six niveaux

Six filières

FilièreObjetExemple de travail
1Santé numérique et systèmes hospitaliers — dossiers médicaux, télémédecine, interopérabilitéConfigurer un dossier patient fictif et son interface d’échange
2Bio-informatique et génomique — analyse de séquences, chaînes de traitement reproductiblesAnalyser un jeu de données public ou synthétique
3Biotechnologie et sciences du vivant — données expérimentales, bioprocédés, traçabilitéConcevoir un flux de suivi d’échantillons fictifs
4Intelligence artificielle appliquée — analyse de données et d’images, modèles exploratoires et leurs limitesÉvaluer un modèle sur données synthétiques, sans usage clinique
5Dispositifs et santé connectée — capteurs, objets connectés, systèmes embarquésPrototyper une chaîne de mesure, hors cadre médical
6Santé publique et épidémiologie — surveillance, modélisation, systèmes nationauxConstruire un indicateur agrégé sur données simulées

Six niveaux, cinquante-quatre semaines

NiveauCe qui s’y acquiertDurée
P0Explorer — santé, biologie, open source, éthique et panorama des six filières4 semaines
P1Builder — installer, configurer, manipuler les données, premières applications8 semaines
P2Integrator — faire communiquer les systèmes, interopérabilité, premiers projets réels10 semaines
P3Platform Engineer — déployer, industrialiser, chaîne de livraison, montée en charge10 semaines
P4Reliability & Security — disponibilité, résilience, cybersécurité, protection des données, continuité10 semaines
P5Systems Architect — architectures, gouvernance, standards, projets d’ampleur nationale ou régionale12 semaines

Ces durées sont des hypothèses de conception pédagogique, non des durées réglementaires ni des certifications reconnues.

Le catalogue à évaluer

DomaineProjets et standards à étudier
Dossier médical et hôpitalOpenMRS, Bahmni, GNU Health
Santé publiqueDHIS2
LaboratoireOpenELIS Global
ImagerieOrthanc ; standard DICOM
InteropérabilitéOpenHIM, HAPI FHIR ; standard HL7 FHIR
Bio-informatiqueBioconductor, Galaxy, Nextflow, nf-core
Chimie computationnelleRDKit, Biopython
Science des donnéesPython, Jupyter, scikit-learn, PyTorch
Identité et secretsKeycloak, OpenBao
ObservabilitéPrometheus, Grafana, OpenTelemetry

Deux confusions à éviter. Un standard ouvert comme HL7 FHIR ou DICOM n’est pas lui-même un logiciel open source. Et une bibliothèque de recherche n’est pas automatiquement un dispositif médical validé.

Ces noms sont des candidats pédagogiques : ni garantie de compatibilité mutuelle, ni d’adéquation clinique, ni de conformité réglementaire. Vérifier versions, licences, documentation, maintenance et conditions d’exploitation avant toute sélection.

Le projet final

Un réseau fictif de cliniques et de laboratoires souhaite partager des informations autorisées et produire des indicateurs agrégés.

Création d’un patient fictif → consultation simulée → demande d’examen → résultat fictif → contrôle d’accès et audit → indicateur agrégé

Une option biotechnologie ajoute une chaîne d’analyse reproductible sur données publiques autorisées ou synthétiques, avec traçabilité des versions et limites scientifiques explicitées.

Les critères d’évaluation

CritèrePoids proposé
Fonctionnalité et reproductibilité25 %
Interopérabilité et qualité des données20 %
Sécurité et confidentialité20 %
Documentation et soutenance20 %
Résilience et exploitation15 %

Barème pédagogique proposé, non certification officielle.

Comment lancer la filière

  • 01Constituer un comité pédagogique associant ingénieurs, professionnels de santé, biologistes et spécialistes de la protection des données
  • 02Définir les acquis d’apprentissage et les prérequis propres à chaque filière
  • 03Installer un laboratoire isolé, alimenté uniquement en données synthétiques ou dûment autorisées
  • 04Lancer une cohorte pilote sur le premier niveau, puis une spécialisation sur un périmètre limité
  • 05Évaluer les livrables, l’accessibilité, les coûts d’exploitation et les retours des partenaires
  • 06Étendre aux autres filières après validation des capacités d’encadrement

Le premier point n’est pas une formalité. C’est la seule filière du dispositif où l’encadrement ne peut pas être uniquement technique : sans professionnels de santé et sans spécialistes de la protection des données au comité pédagogique, le programme ne devrait pas ouvrir.

Aucun tarif, revenu ou débouché professionnel n’est garanti par ce programme.

Les objectifs de développement durable

Cette filière rejoint trois des dix-sept laboratoires proposés par ailleurs : bonne santé et bien-être, industrie et innovation, partenariats.

L’auteur

Portrait de Lionel Sakiti

Lionel Sakiti

Program Manager Cloud & IA souveraines. Il travaille sur les infrastructures de paiement, les programmes de cloud et d’intelligence artificielle souverains et la gouvernance des données dans la zone UEMOA.

contact@africascaler.com